Ola @Júlia Cortez , pelo que vi parece ser um projeto e não um reparo certo ?
Quando temos um sinal filtrado apos o indutor e junto com os capacitores n se deve ter frequência, ja que seu sinal apos a bobina deve ser continuo!(isso se a carga for cc claro).
Na falta de capacitância usando o osciloscópio vc vai notar que a tensão não fica estável e fica descarregando e voltando pro pico, ou ate mesmo passando do valor de pico nominal do projetado, causando outros problemas.
Caso sua tensão esteja abaixando pode ser que a frequência do seu pwm não esteja ajustada para a quantidade de corrente de demanda, ou a sua realimentação negativa não foi ajustada, ou ate mesmo erro de calculo.
Os indutores são importantes para ajuda a filtrar as frequências do lado do pwm e n deixar passar para carga RL, pois assim os capacitores filtra ajustando a tensão de forma que ela fique como corrente continua perfeita, a retirada da bobina vai atrapalhar todo o sinal e leitura do feedback fazendo ela ficar distorcida mesmo usando capacitores.