Já param pra pensa que estás tensões podem ser suspensas? Eu me lembrei de caso recente em uma placa de um HP, acontecia exatamente isso eu plugava a fonte e as tensões de 3, 5V aparecia e após segundos desaparecia. Só que no esquema dessa placa me dizia que as tensões eram suspensas, essa infelizmente não tem a sequencia pra gente ter um certeza, a pesa que as fontes dizem ser ALWS.
Eu estou imaginado que são suspensas estás tensões, por que se olharem a bios e o sio são alimentados com uma tensão gerada apatir da tensão do regulador LDO do CI PU19, pino 7 tensão +5VALW_LDO, que entra no pino 1 Ci PU9, e no pino 3 EN e sai 3,3V no pino 5 tensão +ECVCC, é esta tensão que alimenta a bios e o SIO.
E só uma hipótese!
@Marcio Moreira veja a tensão no pino 14 e pino 27 do PU19 no momento que você pluga a fonte, depois aperte o power e veja nestes mesmos pinos pra ver o que acontece.