Ja estive com problemas com Chipset sul e teve que adaptar um cooler pequeno em cima.
Mas verifique se ele está bem encaixado pois as vezes ele fica meio solto (não indico tirar, pois uma vez tirei e quase lasquei o cristal, porém a placa era antiga).
Outra dica é um simples cooler de 120mm na janela lateral, por que dependendo da placa vai ar mesmo que pouco para o chip... a historia do basico simples cooler na frente soprando ar e atrás puxando também vale a pena.
Outro caso mais estranho que ja aconteceu comigo foi sobre tensão errada na BIOS e agora mais recente fonte com problema... da uma conferida em tudo, vale a pena
Abraços