Olá tcherobin, parece que você não acessa esse post há muito tempo, mesmo assim vou responder suas perguntas.
1) Sim, para carregar o celular você precisará abaixar e regular a tensão. O ideal seria colocar um Zener de 4,3V (1N4731A) na base de um transistor que tenha capacidade de 1A pelo menos, então a tensão de 6V ou um valor acima disso entrará pelo coletor de um NPN e sairá regulada em 5,0V no seu emissor.
2) Para limitar a corrente utilize um resistor de baixo valor, tipo 1ohm, em série com a carga.
3) O correto em sistemas fotovoltaico é utilizar um controlador de carga pois a variação de produção de tensão poderá, ou melhor, irá danificar a bateria sem sombra de dúvida.
4) O melhor vidro para confecção de módulos fotovoltaicos é o vidro temperado com baixo teor de ferro. Além do vidro você vai precisar de uma camada de EVA transparente por cima e outra por baixo, além dos perfis de alumínio.
5) Um tracker solar pode aumentar a eficiência de 15% a 30% segundo alguns estudos que li, porém o grande benefício dos módulos FV é o fato de não ter partes móveis, o que não causa atrito, quando um sistema móvel é adicionado, fatalmente haverá maior manutenção por parada.
Um abraço.