Verifiquei de novo por descargo de consciência...
O pior é que está correto pela grafia na placa, mas só funciona certo se inverter os fios de alimentação do motor e do sensor de passo (tive que remover os cabos do conector, porque tem um balizador para não colocar invertido).
Fiz um teste com o motor de passo também, mas está funcionando certo em outra placa.
Medi as tensões de saída no conector e realmente estão invertidas (positivo no cabo preto e negativo no vermelho, o mesmo no sensor).
Na verdade a minha dúvida era se seria possível o usuário ter realizado algum procedimento por software que causou o erro, mas estou começando a achar que é defeito na placa...
Obrigado por responder e até uma próxima!