Opa, estou com um problema semelhante, percebi no meu caso que um dos PWM's não estava funcionando corretamente, e que este é o responsável por alimentar o processar e chip gráfico. Eu testei as bobinas no tempo em que a máquina permanecia ligada, pois todo o processo de start dura menos de um segundo, eu ainda possuía alguns segundos para testar o que dava.
Experimentar ver se algum destes PWM's está com defeito, pois o equipamento pode desligar-se em caso de falha em algum destes controladores.