Certo, nesse caso acredito que a melhor forma é você fazer medições das fontes internas em uma placa que esteja funcionando para ter como comparação, se você puder alimentar a placa através de uma fonte de bancada é melhor ainda, pois você pode monitorar a corrente e verificar se há um consumo excessivo ou um consumo inferior ao normal.
Uma câmera térmica pode ajudar em alguns casos, mesmo assim teria que comparar com uma placa que esteja funcionando para ter uma referencia, e nem sempre um componente que aquece está com defeito.
Essas placas possuem boa proteção tanto na entrada de alimentação como nas interfaces de comunicação, então é mais provável que tenha falhado algo neste setor do que o próprio FPGA.
Então basicamente você pode fazer a seguinte sequencia de medições.
Verificar alimentação no MCU, PLL e FPGA, o FPGA possui mais de uma alimentação, geralmente 3V3, 1V5, etc.
Verificar os buffers e componentes de proteção contra ESD, LVC514B, e os componentes marcados como Dxx em encapsulamento SOT23-6.
O fato de ela não reconhecer e não apresentar imagem em alguns modelos pode ser uma incompatibilidade de software, o fabricante disponibiliza alguma atualização de firmware?
Att.
Adriano